Należy podkreślić znaczenie jakie dla prawidłowego rozwoju Uczelni ma jej autonomiczność rozumiana jako swoboda podejmowania decyzji przez władze i społeczność akademicką. Dotyczy to również wolności prowadzenia badań naukowych. Oczywiście, nie wyklucza to stosowania tradycyjnych narzędzi oceny, takich jak jakość publikacji, zdolność do pozyskiwania środków finansowych na badania oraz umiejętność budowania zespołów badawczych. Autonomiczność Uczelni i niezależność od aktualnych trendów politycznych wywiera istotny wpływ na jej autorytet i wiarygodność w środowisku zewnętrznym.